Neskatoties uz to, ka MK noteikumos "Par atbalstu Covid-19 krīzes skartajiem uzņēmumiem apgrozāmo līdzekļu plūsmas nodrošināšanai" atbalsta sniegšana vairs netiek veikta, Valsts ieņēmumu dienests (VID), pamatojoties uz tiesas lēmumiem, nodrošina iepriekš nepamatoti nepiešķirtā vai nodokļa maksātāja atmaksātā atbalsta atmaksu.
Veicot valsts atbalsta saņemšanas un izlietošanas pēckontroli, VID uzsāka nodokļu maksātājam izmaksātā valsts atbalsta apgrozāmo līdzekļu plūsmas nodrošināšanai (granta) un procentu par nelikumīgi saņemto atbalstu kopā 29 521,10 euro apmērā atgūšanu. Izskatot nodokļu maksātāja sūdzību, apstrīdētie lēmumi iestādē atstāti negrozīti, kā rezultātā nodokļu maksātājs iesniedza pieteikumu tiesā.
2022. gadā nodokļu maksātājs veica Covid-19 granta atbalstu atmaksu uz Finanšu ministrijas budžeta programmas 99.00.00 "Līdzekļu neparedzētiem gadījumiem izlietojums" izpildei atvērto Valsts kases kontu LV63TREL213005614200B “Covid-19 krīzes skarto uzņēmumu apgrozāmo līdzekļu plūsmas nodrošināšana”.
Ar Administratīvās rajona tiesas 2023. gada 31. augusta spriedumu ir atcelts VID 2022. gada 23. marta lēmums par izmaksātā valsts atbalsta apgrozāmo līdzekļu plūsmas nodrošināšanai atmaksu no tā pieņemšanas dienas; spriedums stājās spēkā 2023. gada 3. oktobrī.
Saskaņā ar Ministru kabineta 2010. gada 28. decembra noteikumu Nr. 1220 “Asignējumu piešķiršanas un izpildes kārtība” 50. punktā noteikto 2022. gadā atmaksātie līdzekļi 2022. gada 31.decembrī tika slēgti kā saimnieciskajā gadā neizmantotie valsts budžeta asignējumi. Līdz ar to, lai izpildītu tiesas lēmumu un atmaksātu atbalstu nodokļu maksātājam, VID ir nepieciešams finansējums no valsts budžeta programmas “Līdzekļi neparedzētiem gadījumiem” atbalsta atmaksas nodrošināšanai.
Atbilstoši Ministru kabineta 2023. gada 26. maija rīkojumam Nr. 288 “Par finanšu līdzekļu piešķiršanu no valsts budžeta programmas “Līdzekļi neparedzētiem gadījumiem”” (prot. Nr. 27 18. §) 2023. gadā VID ir piešķirts finansējums no valsts budžeta programmas 02.00.00 "Līdzekļi neparedzētiem gadījumiem" 45 361 euro apmērā, lai nodrošinātu Covid-19 atbalsta un ar to saistīto maksājumu atmaksu nodokļu maksātājiem. Šobrīd ir izveidojies piešķirtā finansējuma atlikums 18 568 euro apmērā, tādējādi VID ir nepieciešams papildus finansējums 10 954 euro apmērā, lai nodrošinātu atbalsta atmaksu nodokļu maksātājam, teikts rīt valdībā iesniegtā likumprojekta anotācijā.