Izglītības un zinātnes ministrija (IZM) sportam piešķirtos līdzekļus administrē necaurskatāmi un ir pieļāvusi vairāku miljonu latu izlietošanu neskaidriem mērķiem, turklāt aptuveni piektā daļa no visa nozares finansējuma izlietota administrācijas izmaksām, revīzijā konstatējusi Valsts kontrole (VK).
VK revīzijas ziņojumā Valsts budžeta līdzekļu sportam administrēšanas atbilstība normatīvo aktu prasībām Izglītības un zinātnes ministrijā par laiku no 2008. gada sākuma līdz pagājušā gada 30. jūnijam ir izteiktas bažas par 4 550 352 latu izlietojumu neatbilstoši piešķiršanas mērķiem, kā arī pārmestas pārāk lielas administrācijas izmaksas – šim nolūkam izlietoti apmēram 18 procenti no nozarei paredzētā valsts finansējuma. Tāpat VK nav skaidrs, kāpēc valsts budžetā nav ieskaitīti atpakaļ vairāk nekā 500 000 latu, kas piešķirti kā drošības nauda starptautisku sacensību organizēšanai un ko starpvalstu organizācijas pēc spēļu norises atmaksā organizētājam. IZM ir pārmesta arī nepietiekama kontrole par atalgojumu valsts finansētajās organizācijās strādājošajiem – tas līdz pat trīs reizēm pārsniedz vidējo algu gan sabiedriskajā, gan privātajā sektorā. Neilgi pēc VK ziņojuma IZM izplatīja informāciju, ka finansējuma piešķiršana un uzraudzība nozarē tiek mērķtiecīgi pilnveidota, kā piemērus minot prasību paaugstināšanu valsts finansējuma saņēmējiem – turpmāk administrācijas izdevumi nedrīkstēs pārsniegt 15 procentu un visas izmaiņas izdevumos rakstiski jāsaskaņo ar ministriju. Ja organizācijas finansējumu izlietos neatbilstoši līgumam, nākamajā gadā to samazinās, bet ikmēneša atskaišu nenodošana draud ar to, ka nākamajā mēnesī finansējumu organizācijas bankas kontā neieskaitīs. Tāpat IZM sola līdz šā gada beigām ieviest VK ieteikumus finansējuma sistēmas pilnveidei sporta nozarē. Uz jautājumu, vai pret organizācijām, uz kuru pārkāpumiem norādījusi VK, plānots piemērot sankcijas, IZM pārstāve atbild izvairīgi – "katrs gadījums jāvērtē atsevišķi" un "rūpīgi jāiepazīstas ar notikušā apstākļiem". VK ziņojumā norādīts, ka sporta federācijas pusotra gada laikā 16 procentu no piešķirtajiem līdzekļiem jeb gandrīz 29 000 latu izlietojušas mēbeļu iegādei, telpu uzturēšanai un citām saimnieciskām darbībām, lai gan finansējums federācijām jāizlieto naudas balvās par izciliem sasniegumiem sportā un sporta veidu un jaunatnes programmu attīstības veicināšanai. Tāpat divas sporta federācijas kopā ar atskaitēm par attaisnotajiem izdevumiem 74 273 latu apmērā iesniegušas tādus pašus maksājuma dokumentus, ko Latvijas Olimpiskā komiteja. Latvijas Sporta federāciju padomes prezidents Andris Kalniņš norāda, ka padome līdz šim nav drīkstējusi pārbaudīt federāciju dokumentus, bet pašlaik ir izstrādāts nolikums, kas ļautu veikt pilnu izdevumu kontroli. A. Kalniņš arī uzsver, ka sporta federācijām administratīvās izmaksas ir nelielas un tās nepieciešamas, lai organizētu un piedalītos starptautiska mēroga sacensībās.